288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0940 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  309  9e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  80.79 
 
 
151 aa  258  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  62 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  61.59 
 
 
149 aa  184  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  49.67 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  45.03 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  43.71 
 
 
149 aa  140  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  43.05 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  43.05 
 
 
149 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  36.54 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  42.53 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  41.18 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  28.75 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  32.72 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  30.49 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  31.61 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  42.53 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  30.86 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  29.68 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  41.18 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  27.74 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  31.17 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  29.56 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  30.97 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  38.64 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  42.22 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  41.18 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  33.71 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  41.3 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  40.23 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  29.63 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  45.88 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  44.71 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  29.19 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  31.79 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  27.27 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  31.87 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  40.45 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  38.37 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  42.53 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  43.21 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  31.48 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  32.5 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  38.82 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  40.45 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  40.7 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  43.37 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  42.16 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  35.51 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  25.83 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  38.64 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  35.23 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  41.18 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>