289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0139 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  97.99 
 
 
149 aa  298  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  97.32 
 
 
153 aa  296  7e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  63.58 
 
 
151 aa  201  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  47.68 
 
 
151 aa  148  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  50.35 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  47.65 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  43.05 
 
 
151 aa  138  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  44.37 
 
 
151 aa  135  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  36.13 
 
 
154 aa  95.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  41.43 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  42.73 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  42.45 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
159 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  42.73 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  42.73 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  41.82 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  36.13 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  41.82 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  45.83 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  41.82 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  41.82 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  36.77 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  40.57 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  49.41 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  39.29 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  42.31 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  37.42 
 
 
153 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  36.88 
 
 
159 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
155 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  45.83 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  45.83 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  47.13 
 
 
156 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  40.2 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  33.55 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  39.22 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  36.59 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  31.65 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  34.38 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  38.13 
 
 
159 aa  84.3  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  39.22 
 
 
155 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  38.68 
 
 
155 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  47.13 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  31.01 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
160 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  42.71 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  41.11 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  33.53 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  33.53 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  44.58 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.38 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  29.75 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  48.24 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  43.53 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  47.67 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  51.76 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  51.76 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  44.32 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  35.83 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  40.37 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  33.55 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  39.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  28.66 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  40.2 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  41.18 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  45.88 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  33.79 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  31.48 
 
 
159 aa  76.6  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  28.93 
 
 
153 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.72 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  32.08 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  44.58 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  39.81 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  39.53 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  38.24 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  42.17 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  41.57 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  29.81 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  37.25 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>