289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1137 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1137  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
145 aa  288  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240121  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  65.52 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  55.86 
 
 
145 aa  156  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  43.54 
 
 
148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  44.16 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  43.51 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  43.51 
 
 
153 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  40.26 
 
 
153 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  38.46 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 
155 aa  94.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  32.26 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  34.38 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  35.22 
 
 
160 aa  90.1  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  40.91 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
155 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  33.75 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  38.89 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  38.71 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  36.94 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  37.5 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  36.13 
 
 
156 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  34.9 
 
 
144 aa  87  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  87  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
159 aa  86.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 
159 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  35.9 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  38.22 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  35.26 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  32.68 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  32.89 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  36.84 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  31.25 
 
 
159 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  29.87 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  34.27 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  33.55 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  33.96 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  31.45 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  30.82 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2950  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  34.72 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2563  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>