More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0868 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
132 aa  270  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  63.48 
 
 
119 aa  155  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  63.39 
 
 
117 aa  150  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  61.21 
 
 
118 aa  149  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  57.14 
 
 
118 aa  134  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  58.25 
 
 
121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
113 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  52.21 
 
 
121 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
114 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  52.21 
 
 
121 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
118 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
114 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  51.33 
 
 
121 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
113 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  50.46 
 
 
114 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
114 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  51.38 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.36 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
114 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  44.04 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 
114 aa  115  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  44.04 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
113 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
114 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
114 aa  114  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 
113 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
118 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 
114 aa  110  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.04 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.3 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  44.95 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  42.2 
 
 
121 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
112 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
115 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
114 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  41.28 
 
 
118 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  44.95 
 
 
114 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  43.12 
 
 
114 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
127 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
117 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.95 
 
 
115 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
116 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  46.6 
 
 
117 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
126 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
112 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 
119 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
122 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
126 aa  103  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
119 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  43.12 
 
 
113 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  43.12 
 
 
113 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
112 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 
116 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
121 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
119 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
115 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  44.76 
 
 
116 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
120 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
114 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
135 aa  101  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
119 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
112 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
119 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
116 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
116 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
115 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
113 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
113 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
119 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  42.45 
 
 
116 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 
117 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
115 aa  100  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
113 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  47.66 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  41.96 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  45.28 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  42.98 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  41.51 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>