63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4141 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  56.73 
 
 		 347 aa  281  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  48.61 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  49.14 
 
 		 368 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  47.77 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  48.11 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  48.11 
 
 		 368 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  47.24 
 
 		 356 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  46.18 
 
 		 395 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  46.23 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  45.1 
 
 		 355 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  44.41 
 
 		 355 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  43.36 
 
 		 355 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  43.71 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  39.37 
 
 		 357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  46.29 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  47.22 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  47.57 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  39.92 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  53.53 
 
 		 214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  148  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  76.74 
 
 		 86 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  76.74 
 
 		 86 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  30.83 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  50.32 
 
 		 214 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  31.82 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  31.8 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2874  hypothetical protein  78.67 
 
 		 160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110212  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  43.06 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  47.56 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  75.81 
 
 		 143 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  52.17 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  42.96 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  41.48 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  26.79 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  41.72 
 
 		 161 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  44.34 
 
 		 182 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  31.9 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  46.07 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  32.52 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  41.18 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  48.68 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  36.07 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  36.07 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  46.38 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  35.2 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0535  hypothetical protein  38.54 
 
 		 121 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  40.48 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  45.63 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  44.07 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  42.27 
 
 		 130 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  32.29 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  32.29 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  26.52 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7422  hypothetical protein  56.25 
 
 		 58 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.628262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  31.13 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  31.13 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  37.74 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>