15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2874 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2874  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110212  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  82.89 
 
 		 86 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  82.89 
 
 		 86 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  78.67 
 
 		 296 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7422  hypothetical protein  64.58 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.628262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  44.12 
 
 		 368 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 355 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  33.63 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  33.96 
 
 		 355 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 355 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  40.28 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  37.84 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  44.62 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  39.71 
 
 		 356 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  39.71 
 
 		 252 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>