26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2306 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  166  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  166  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  76.74 
 
 
296 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2874  hypothetical protein  82.89 
 
 
160 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110212  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7422  hypothetical protein  72.92 
 
 
58 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.628262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  46.51 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  44.19 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  48.72 
 
 
214 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  43.02 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  44.19 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  43.02 
 
 
355 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  41.86 
 
 
368 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  41.86 
 
 
368 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  41.86 
 
 
368 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  44.19 
 
 
355 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  41.86 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  41.86 
 
 
368 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  43.02 
 
 
355 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  40.7 
 
 
368 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  42.35 
 
 
355 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  39.53 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  41.86 
 
 
355 aa  42  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  41.33 
 
 
347 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  41.46 
 
 
395 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  43.75 
 
 
214 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  38.37 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>