57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3133 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  80.57 
 
 		 282 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  46.59 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  29.21 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  30.53 
 
 		 803 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  38.43 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  31.51 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.28 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  24.45 
 
 		 468 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  24.63 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.72 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  31.5 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  27.31 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  25 
 
 		 504 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  33.01 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  31.47 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  27.95 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  26.23 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.8 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  26.22 
 
 		 423 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  24.8 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  26.12 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  23.81 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  31.91 
 
 		 496 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.32 
 
 		 440 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  32.89 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  27.64 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  24.34 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  28.05 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  36.54 
 
 		 516 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  35.63 
 
 		 504 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03370  hypothetical protein  37.58 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  36 
 
 		 513 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  26.74 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  29.26 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  30.99 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  30.99 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.03 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  26.54 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  29.56 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.03 
 
 		 425 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  23.94 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  28.66 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  26.59 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  28.66 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  28.66 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 414 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  28.66 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  28.66 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  28.05 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  28.66 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  29.82 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  29.82 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  25.43 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  29.93 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  30.94 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>