210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2692 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  41.72 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  35.12 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.1 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  36.88 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  30.45 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 147 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  47.17 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  40.26 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  45.1 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.46 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 127 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 135 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  42 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  43.14 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  26.92 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  28.89 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  30.85 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.25 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 138 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>