More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2277 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  49.04 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 226 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  40.43 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  39.62 
 
 		 208 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  42.55 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  35.96 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  33.09 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 364 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  38.18 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  34.69 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  38.74 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  38.05 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  30.49 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 1287 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.23 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.48 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  28.07 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  29.65 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.58 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  37.23 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.66 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  32.04 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.66 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  30.77 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.78 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.66 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.89 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  33.86 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3840  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.598464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.65 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.75 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.75 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  37.07 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  34.91 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.91 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.08 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.94 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.91 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  28 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.79 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  29.79 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  25.41 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  34.91 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.14 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00511048  normal  0.410057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>