89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1274 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 77 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  76.62 
 
 		 77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 		 77 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  61.04 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  62.34 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 82 aa  94  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 77 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  56.41 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  67.53 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  62.34 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  54.67 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  43.84 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  44.29 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  38.98 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  26.39 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 148 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>