195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0556 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  53.26 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  45.56 
 
 		 281 aa  242  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  45.59 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  44.36 
 
 		 269 aa  215  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  38.14 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  44.25 
 
 		 182 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  37.27 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  44.83 
 
 		 297 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  42.53 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  30.86 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  35.22 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  35.22 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  37.81 
 
 		 356 aa  118  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  38.17 
 
 		 393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 395 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  37.1 
 
 		 377 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  37.63 
 
 		 386 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  37.1 
 
 		 386 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  37.37 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  34.98 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 		 372 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  32.83 
 
 		 352 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  34.33 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  35.2 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 390 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  33.17 
 
 		 375 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  35.71 
 
 		 390 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  35.71 
 
 		 390 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  37.7 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  35.38 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 387 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  34 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 380 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 374 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  32.98 
 
 		 384 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  34.17 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 363 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  32.21 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  33.68 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  32.54 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  33.85 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  32.99 
 
 		 350 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  34.72 
 
 		 366 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 359 aa  99  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 352 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 352 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 437 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  33.52 
 
 		 360 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  33.17 
 
 		 352 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 352 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  33.87 
 
 		 360 aa  95.9  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  29.44 
 
 		 290 aa  95.9  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 		 352 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 358 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  32.99 
 
 		 361 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1576  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 423 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 368 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1575  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 342 aa  92.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.05 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 360 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  31.51 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  29.67 
 
 		 392 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 392 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 388 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 421 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>