More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6592 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  53.93 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  50.17 
 
 
309 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  56.27 
 
 
295 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  52.13 
 
 
287 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  47.48 
 
 
281 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  45.86 
 
 
291 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  47.5 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  45.88 
 
 
296 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  37.39 
 
 
287 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  33.33 
 
 
280 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  33.22 
 
 
287 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  31.16 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  29.39 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  33.04 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
287 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 
290 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 
290 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 
290 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  32.87 
 
 
287 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  36.55 
 
 
280 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 
290 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  36.09 
 
 
287 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  36.09 
 
 
287 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  35.2 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  26.72 
 
 
290 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  35.2 
 
 
287 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  32.02 
 
 
284 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 
283 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 
290 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  33.49 
 
 
232 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  26.52 
 
 
290 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  33.81 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  33.65 
 
 
313 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  34.15 
 
 
299 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  33.64 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  34.17 
 
 
285 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 
284 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  31.75 
 
 
234 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  30.77 
 
 
299 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 
331 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  26.94 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  35.42 
 
 
295 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30.66 
 
 
286 aa  132  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  30 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  30.43 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  25.89 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 
232 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  29.13 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  32.23 
 
 
273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  23.78 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  36.07 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  30.07 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  27.72 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  34.96 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  35.75 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  28.06 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  25.78 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  30.33 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
307 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  36.19 
 
 
307 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  25.89 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  25.89 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.01 
 
 
305 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.4 
 
 
308 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 
290 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30 
 
 
302 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  27.39 
 
 
293 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
299 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  34.53 
 
 
909 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  30.7 
 
 
306 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  34.02 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  32.13 
 
 
300 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  30.95 
 
 
232 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  38.22 
 
 
299 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  37.55 
 
 
323 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  25.09 
 
 
286 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
230 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  28.27 
 
 
299 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.58 
 
 
293 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  34.56 
 
 
315 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  34.26 
 
 
314 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  27.31 
 
 
289 aa  122  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  39.81 
 
 
302 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  34.04 
 
 
316 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  36.28 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  29.08 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  28.14 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  25.9 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.53 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  26.55 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>