More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4218 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 398 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.89 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.84 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  51.12 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  46.31 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  48.81 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.96 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.61 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.31 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.4 
 
 		 417 aa  205  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  50.64 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  40.19 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.83 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  41.29 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.78 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  42.12 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  40.56 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  37.07 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  41.03 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.3 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  44.9 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  36.19 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  41.8 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  42.21 
 
 		 374 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  45.1 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.39 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  39.71 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.44 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  43.1 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  40.91 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.04 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  45.28 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.48 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.84 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  39.84 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.62 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.56 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  36.7 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.17 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.67 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  42.92 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 612 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  39.74 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.11 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.8 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  34.3 
 
 		 393 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.96 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.69 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  41.41 
 
 		 518 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  35.89 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.47 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 441 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.58 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.93 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  36.51 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  38.96 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.99 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  34.83 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  36.1 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.62 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.19 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.68 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  36.8 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.55 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  35.68 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.82 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.25 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  32.01 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0572952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  39.66 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0270  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>