82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3413 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 681 aa  1345    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  59.51 
 
 		 692 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  35.59 
 
 		 819 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  34.48 
 
 		 827 aa  74.3  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  39.66 
 
 		 766 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  34.53 
 
 		 818 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  35.56 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  31.71 
 
 		 821 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.41 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  31.71 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  26.55 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  32.85 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  28.57 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  28.64 
 
 		 805 aa  54.3  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  29.91 
 
 		 304 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  23.4 
 
 		 704 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  31.4 
 
 		 287 aa  52  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  33.06 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  26.57 
 
 		 749 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.06 
 
 		 1078 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  31.4 
 
 		 287 aa  50.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  32.65 
 
 		 286 aa  50.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  29.17 
 
 		 288 aa  50.8  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  32.37 
 
 		 302 aa  50.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  31.4 
 
 		 296 aa  50.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  31.4 
 
 		 296 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  27.81 
 
 		 567 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  31.4 
 
 		 296 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  33.61 
 
 		 314 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  31.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  32.48 
 
 		 349 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  29.92 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  31.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  31.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  31.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  31.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  29.81 
 
 		 334 aa  48.9  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  31.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  29.59 
 
 		 279 aa  48.9  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  32.71 
 
 		 515 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  30.58 
 
 		 289 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  31.09 
 
 		 279 aa  48.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  32.17 
 
 		 326 aa  47.8  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  30.61 
 
 		 280 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  30.61 
 
 		 280 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  26.71 
 
 		 308 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  33.9 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24640  spermidine synthase  27.74 
 
 		 283 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.845245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  32.5 
 
 		 283 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  29.75 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  30.58 
 
 		 288 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  32.84 
 
 		 783 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  33.75 
 
 		 280 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  33.75 
 
 		 279 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  29.06 
 
 		 1040 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26.4 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  29.27 
 
 		 1017 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  26.52 
 
 		 889 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  29.37 
 
 		 280 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  31.03 
 
 		 301 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.27 
 
 		 286 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  27.27 
 
 		 291 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  36.47 
 
 		 289 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.22 
 
 		 248 aa  44.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.6 
 
 		 551 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  29.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  29.31 
 
 		 806 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  31.25 
 
 		 289 aa  44.3  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.3 
 
 		 283 aa  43.9  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  29.51 
 
 		 308 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  29.51 
 
 		 308 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  27.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5656  Spermine synthase  26.98 
 
 		 281 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  27.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>