76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3363 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  89.04 
 
 
146 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  86.99 
 
 
147 aa  269  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  83.56 
 
 
146 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  84.93 
 
 
147 aa  254  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  84.25 
 
 
147 aa  253  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  83.56 
 
 
147 aa  253  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  65.49 
 
 
142 aa  214  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  65.03 
 
 
143 aa  203  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  65.28 
 
 
142 aa  200  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  61.74 
 
 
151 aa  199  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  68.99 
 
 
142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  59.03 
 
 
152 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  63.64 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  45.19 
 
 
689 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  39.6 
 
 
688 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  34.15 
 
 
670 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  37.33 
 
 
363 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.93 
 
 
389 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  38.03 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  37.84 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  28.48 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  31.88 
 
 
377 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.99 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 
454 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.5 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 
252 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  26.54 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
432 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  31.03 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  31.03 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  29.89 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  29.77 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  43.14 
 
 
173 aa  42  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 
388 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.36 
 
 
1240 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.53 
 
 
480 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  25.6 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.1 
 
 
144 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.01 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  26.13 
 
 
135 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
406 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 
103 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  29.63 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  26.44 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  25.83 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  24.64 
 
 
353 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  25.71 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  26.5 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  23.58 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 
171 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  24.81 
 
 
177 aa  40.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  26.19 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  28.57 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  22.77 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.91 
 
 
125 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  25.42 
 
 
401 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28.24 
 
 
124 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>