More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3719 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  100 
 
 		 476 aa  956    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  53.42 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.64 
 
 		 471 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  50.79 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 470 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  51.5 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.38 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.68 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.68 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.27 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  46.04 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.91 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 501 aa  350  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 492 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 503 aa  302  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.89 
 
 		 500 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 499 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 485 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.23 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 520 aa  292  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.82 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.1 
 
 		 509 aa  286  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.44 
 
 		 497 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.5 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.45 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 503 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.22 
 
 		 507 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 496 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 503 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 516 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.2 
 
 		 501 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 517 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 501 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.93 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.98 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.58 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 508 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.51 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 523 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.2 
 
 		 503 aa  276  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.73 
 
 		 501 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 490 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0661  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 493 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  36.38 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  38.62 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  35.11 
 
 		 475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.26 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 501 aa  273  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 465 aa  273  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 509 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 509 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>