202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0106 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  100 
 
 
399 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  61.44 
 
 
384 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  61.44 
 
 
393 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  61.44 
 
 
393 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  61.44 
 
 
384 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  61.44 
 
 
384 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  60.64 
 
 
384 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  61.17 
 
 
384 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  60.9 
 
 
384 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  46.11 
 
 
409 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  46.68 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  45.12 
 
 
409 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  45.31 
 
 
409 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  46.93 
 
 
409 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  47.24 
 
 
408 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  46.05 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 
414 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  40.31 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  41.73 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  46.72 
 
 
398 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  46.45 
 
 
398 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  45.82 
 
 
398 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  44.06 
 
 
391 aa  242  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  43.12 
 
 
408 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  38.16 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  43.16 
 
 
420 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 
389 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  39.79 
 
 
401 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  39.53 
 
 
401 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  39.53 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  44.95 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  39.01 
 
 
401 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
389 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  42.38 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  41.6 
 
 
390 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  39.14 
 
 
398 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  37.73 
 
 
392 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  37.73 
 
 
392 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  39.79 
 
 
392 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  42.49 
 
 
404 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  37.86 
 
 
394 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  41.85 
 
 
390 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  36.57 
 
 
427 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.97 
 
 
396 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
393 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  41.82 
 
 
394 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.25 
 
 
394 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  43.77 
 
 
401 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  43.77 
 
 
394 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  43.77 
 
 
394 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  43.77 
 
 
394 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 
384 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
404 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
404 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  35.15 
 
 
426 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
426 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 
395 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 
395 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  43.69 
 
 
332 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  34.32 
 
 
409 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  34.32 
 
 
414 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  32.45 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  34.17 
 
 
407 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  33.04 
 
 
426 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  32.46 
 
 
426 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  35.29 
 
 
401 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  35.42 
 
 
403 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.88 
 
 
403 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.88 
 
 
403 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  31.87 
 
 
426 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  31.87 
 
 
434 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.84 
 
 
434 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  32.68 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  32.1 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  31.65 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  31.81 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  30.23 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  34.02 
 
 
424 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
413 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  30.17 
 
 
403 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
430 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  30.29 
 
 
391 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  29.89 
 
 
382 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  34.99 
 
 
424 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.03 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  30.77 
 
 
402 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
397 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  32.27 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  35.51 
 
 
459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  30.47 
 
 
405 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1245  major facilitator transporter  34.92 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.356347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  30.79 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  31.48 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>