88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4124 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 94 aa  183  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  78.72 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  73.4 
 
 		 95 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  76.6 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  62.37 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.64 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  59.78 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  59.57 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  59.14 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  59.34 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  59.14 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  54.35 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  54.44 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 		 93 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 		 93 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  48.35 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  26.19 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  37.88 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0854  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000145562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 78 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>