246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3213 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  809    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 434 aa  298  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0659  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1625  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 500 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.776892  normal  0.880919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.4 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  25.94 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  25.94 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  25.94 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  25.94 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  25.94 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  25.94 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.19 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.18 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  26.42 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  28.71 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.07 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  27.11 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  27.11 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  27.11 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.91 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.37 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.07 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.07 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  23.65 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.63 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  25.99 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  25.42 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  24.88 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.67 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.48 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  25.45 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.67 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  27.27 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.93 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.76 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.45 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  23.79 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  27.05 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  24.86 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  30.97 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>