214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2743 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2743  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 152 aa  294  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00755708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13822  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.68 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08470  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.76 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  30.56 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0323  transcription elongation factor GreB  36.43 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.276985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6110  transcription elongation factor GreB  31.58 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  27.08 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0950  transcription elongation factor GreB  30.92 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380314  hitchhiker  0.0000173092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1201  transcription elongation factor GreB  30.57 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0727535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0865  transcription elongation factor GreB  30.92 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2723  transcription elongation factor  33.86 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  27.03 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  28.86 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2152  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000119957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  30.65 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  29.08 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2396  transcription elongation factor GreB  33.06 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  34.43 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  27.78 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0909  transcription elongation factor GreB  31.39 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  25.69 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1126  transcription elongation factor GreB  29.03 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.19101e-20  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2470  transcription elongation factor GreB  30.14 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0253654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0673  transcription elongation factor GreB  31.67 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0253655  normal  0.983843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1778  transcription elongation factor GreB  29.77 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  31.2 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4110  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000102094  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  37.36 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2273  transcription elongation factor GreB  31.4 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0523  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000760648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0862  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000987565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0962  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00012209  normal  0.571045 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1002  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0052225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0874  transcription elongation factor GreB  32.23 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0745968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  28.28 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4263  transcription elongation factor GreA/GreB  35.85 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4017  transcription elongation factor GreB  29.85 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11479  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1756  GreA/GreB family elongation factor  34.07 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0859  transcription elongation factor GreB  29.45 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  36.67 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0183  transcription elongation factor GreA  25.19 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.346208  hitchhiker  0.0000567891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  49.21 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  27.78 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3081  transcription elongation factor GreB  30.66 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0292072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0732  transcription elongation factor GreB  31.82 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  26.03 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1103  GreA/GreB family elongation factor  27.45 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000308289  normal  0.0184015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  36.78 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  30.57 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  26.03 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4333  GreA/GreB family elongation factor  36.09 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  32.24 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3586  transcription elongation factor GreB  31.13 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687664  hitchhiker  0.00676969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3785  transcription elongation factor GreB  29.66 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4601  transcription elongation factor GreB  35.35 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1591  transcription elongation factor GreB  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000320355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2119  GreA/GreB family elongation factor  36.3 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0307  transcription elongation factor GreB  29.66 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0307  transcription elongation factor GreB  29.66 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0482378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  30.07 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3603  transcription elongation factor GreB  29.66 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  34.74 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  27.21 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1950  transcription elongation factor GreB  31.4 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697488  normal  0.0597094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03258  transcription elongation factor GreB  28.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  26.76 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4722  transcription elongation factor GreA  29.93 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3687  transcription elongation factor GreB  28.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.875681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4723  transcription elongation factor GreA  29.93 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03210  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4712  transcription elongation factor GreB  28.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0710  transcription elongation factor GreA  29.93 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0264242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  28.87 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3454  transcription elongation factor GreB  30.15 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000036573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4588  transcription elongation factor GreA  29.93 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3880  transcription elongation factor GreB  28.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2668  transcription elongation factor GreB  32.03 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049462  normal  0.0488826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2091  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3044  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00484653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1871  transcription elongation factor GreB  27.41 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1838  GreA/GreB family elongation factor  34.81 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  30.92 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  28 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3704  transcription elongation factor GreB  29.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3307  transcription elongation factor GreB  25.74 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000320561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3872  transcription elongation factor GreB  29.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  26.71 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0820  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2653  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0303907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2944  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3010  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.998685  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1959  transcription elongation factor GreB  34.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3776  transcription elongation factor GreB  29.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3701  transcription elongation factor GreB  29.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  29.75 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  25.35 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  27.97 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>