More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0357 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0357  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 393 aa  775    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  52.43 
 
 		 1062 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  51.46 
 
 		 1067 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  32.29 
 
 		 1050 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  31.43 
 
 		 1001 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  29.72 
 
 		 691 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  28.45 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  24.78 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  27.97 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0721  UvrD/REP helicase  32.11 
 
 		 701 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 716 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  31.19 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 707 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  29.52 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  30.28 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  41.86 
 
 		 1032 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  27.43 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  27.43 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  27.43 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  32.32 
 
 		 1089 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  27.43 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.67 
 
 		 756 aa  62.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  27 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0554  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.08 
 
 		 849 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  25.12 
 
 		 845 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 		 724 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  55.36 
 
 		 1156 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 659 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  53.57 
 
 		 1124 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.25 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 735 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  25.14 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  31.25 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  27.14 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  29.52 
 
 		 724 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.67 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  24 
 
 		 723 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  29.29 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.69 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0339  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 762 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  35.71 
 
 		 1078 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  25.73 
 
 		 729 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.43 
 
 		 757 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.26 
 
 		 730 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  24.51 
 
 		 727 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.82 
 
 		 660 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.26 
 
 		 730 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.96 
 
 		 682 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.48 
 
 		 694 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  27.14 
 
 		 726 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.74 
 
 		 760 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  26.43 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  26.43 
 
 		 726 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  33.7 
 
 		 1132 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  22.48 
 
 		 815 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  37.35 
 
 		 705 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  26.75 
 
 		 671 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 662 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  24.51 
 
 		 727 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 807 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.18 
 
 		 665 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.22 
 
 		 691 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 708 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  25.82 
 
 		 1707 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 864 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  23.61 
 
 		 724 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.71 
 
 		 718 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  23.11 
 
 		 724 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  48.28 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  31.52 
 
 		 739 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.43 
 
 		 726 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  25 
 
 		 727 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.56 
 
 		 725 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.73 
 
 		 739 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  29.61 
 
 		 742 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 695 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.92 
 
 		 772 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 		 728 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  27.14 
 
 		 741 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  39.29 
 
 		 657 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 		 725 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  30.86 
 
 		 731 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 786 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  44.16 
 
 		 728 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  26.43 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26.43 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  26.43 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26.43 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 723 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  56.25 
 
 		 659 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  26.43 
 
 		 720 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  37.08 
 
 		 641 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>