More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0722 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0722  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.1 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  25.62 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  24.28 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  27.22 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1434  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  19.78 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  27.48 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  24 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  22.27 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1176  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  22.18 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  19.79 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  23.37 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  20.55 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  19.44 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  24.18 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0475  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  25.28 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  23.26 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  21.52 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  26.47 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4612  transcriptional regulator, LysR family  21.52 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.681307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  21.62 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  21.45 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  22.12 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  22.12 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  19.86 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  23.68 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2695  LysR substrate-binding protein  20.4 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  22.96 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  31.36 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  22.96 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.56 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  22.92 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  26.13 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6151  transcriptional regulator, LysR family  22.26 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  24.21 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25320  transcriptional regulator  23.36 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  22.18 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  22.18 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  23.77 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  24.71 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  24.71 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  23.26 
 
 		 699 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>