More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0525 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  74.4 
 
 
207 aa  321  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  55.72 
 
 
209 aa  240  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
209 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2096  uracil phosphoribosyltransferase  53.81 
 
 
208 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2757  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
208 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2645  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
208 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0438743  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2693  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
208 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
208 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2866  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
208 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2093  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  235  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000398312  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  54.5 
 
 
203 aa  234  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3186  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
208 aa  234  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
303 aa  234  8e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1130  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1514  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000447278  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
211 aa  232  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0947  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  232  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2991  uracil phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 
208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1078  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  231  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
208 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
209 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
209 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1235  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0527635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1352  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3121  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116338  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2389  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
209 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
209 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
209 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
209 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
209 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
209 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
209 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  55.22 
 
 
209 aa  228  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  227  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
213 aa  227  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
370 aa  227  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1453  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
208 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2544  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
208 aa  226  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000155874  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
209 aa  226  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2548  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
208 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000189333  hitchhiker  0.0000000219395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
208 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1774  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
208 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411747  normal  0.785811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
208 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002782  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
210 aa  225  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2759  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
208 aa  225  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1448  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
208 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2379  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
208 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  0.622917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2451  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
208 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00571838  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03199  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
210 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1597  uracil phosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
208 aa  225  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000154969  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl107  uracil phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
207 aa  223  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 
207 aa  223  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
209 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
207 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
208 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1628  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
208 aa  222  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.741062  normal  0.0335105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1846  Uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
208 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000894444  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2576  uracil phosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
208 aa  222  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
211 aa  222  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2743  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000380844  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
209 aa  221  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
207 aa  221  7e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
208 aa  221  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1341  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.281958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0911  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399443 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 
208 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 
209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0997  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
209 aa  218  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
211 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 
214 aa  217  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>