More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4997 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 333 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  95.78 
 
 		 334 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  72.27 
 
 		 329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  58.41 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  54.6 
 
 		 336 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  54.37 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  55.24 
 
 		 337 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  54.29 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  53.65 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  56.42 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  61.37 
 
 		 338 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  55.36 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  54.23 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 		 340 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  54.06 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 		 341 aa  331  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.3 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.3 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  52.87 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50.16 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  52.04 
 
 		 315 aa  322  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  51.75 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  53.4 
 
 		 366 aa  318  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  51.55 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  55.33 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  52.32 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  53.33 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  54.11 
 
 		 353 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  54.58 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  54.27 
 
 		 321 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  53.92 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  52.9 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  49.83 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  46.52 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  46.67 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.69 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  47.65 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  47.65 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  47.37 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  47.37 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  42.41 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49.66 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.01 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 		 324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.15 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  45.71 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  49.15 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.62 
 
 		 315 aa  266  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  49.37 
 
 		 321 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  44.21 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.03 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.53 
 
 		 321 aa  262  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  43.96 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  47.96 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  46.98 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  43.87 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  45.57 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  44.1 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.29 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  48.45 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  48.63 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  47.77 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.05 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  42.99 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.03 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  45.12 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43.08 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  48.97 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  48.97 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  48.03 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  43.88 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  48.15 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  44.29 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  42.02 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  44 
 
 		 332 aa  248  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  43.94 
 
 		 325 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  48.15 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  43.06 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  46.65 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  45.97 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  45.3 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  47.1 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  43.94 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>