More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2971 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  68.97 
 
 		 254 aa  337  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  68.3 
 
 		 251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  66.67 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  66.38 
 
 		 261 aa  324  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  58.44 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  54.36 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  55.17 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  56.03 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  58.3 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  54.59 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  55.31 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  54.78 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  53.1 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  55 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  51.53 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  53.18 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  34.39 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.74 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.84 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  40.22 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  36.22 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.55 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.79 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.04 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  32.61 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.33 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.69 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  38.54 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.82 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.53 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.53 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  33.49 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  34.25 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  34.72 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  37.22 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  41.1 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  34.58 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  32.04 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.06 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  42.25 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  39.01 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.67 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.4 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  38.89 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  32.82 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  37.04 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.08 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.61 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  39.31 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  35.08 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.92 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  32.51 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  30.17 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  35.82 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  32.32 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  30.08 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  32.65 
 
 		 947 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  33.68 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  39.64 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  36.88 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  34.76 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.02 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.18 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  37.75 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  36.71 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  33.99 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.85 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  34.54 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  34.44 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  36.08 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  35.87 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  36.13 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>