More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1955 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  74.57 
 
 		 410 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  78.22 
 
 		 405 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 408 aa  831    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  77.72 
 
 		 406 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  74.57 
 
 		 410 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  73.84 
 
 		 410 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  65.33 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  60.1 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  45.23 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  47.5 
 
 		 406 aa  319  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  42.86 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  43.18 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  43.03 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 393 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 395 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  42.54 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.63 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  42.22 
 
 		 417 aa  299  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  43.88 
 
 		 394 aa  296  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  41.67 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  41.56 
 
 		 393 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  41.67 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  41.67 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  41.67 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  41.67 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  41.67 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  41.67 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  43.29 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.81 
 
 		 404 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  44.74 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  38.9 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  39.01 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.75 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 394 aa  276  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  42.6 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 463 aa  272  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 396 aa  272  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.31 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  39.26 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.97 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.01 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.4 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  39.7 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  39.6 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  38.24 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  38.82 
 
 		 611 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.13 
 
 		 416 aa  262  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  39.76 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  39.75 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.57 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  40.69 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  40.24 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 432 aa  255  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 416 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  37.31 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.31 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.82 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.97 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>