More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1469 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  100 
 
 		 402 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  67.53 
 
 		 405 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  66.75 
 
 		 388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  65.36 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  56.32 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  56.4 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  56.14 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  57.85 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  45.45 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  49.1 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  50.66 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  49.47 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  48.82 
 
 		 388 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  45.65 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  46.6 
 
 		 391 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.47 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  45.91 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  48.28 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  48.65 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  46.9 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  44.3 
 
 		 393 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  41.49 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.22 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  39.11 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.38 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  40.42 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  43.08 
 
 		 368 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  45.33 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  40.42 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.41 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2365  aminotransferase, class V  44.85 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  35.51 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  36.45 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.17 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  35.81 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  37.03 
 
 		 398 aa  229  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  38.2 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  42.63 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  40.7 
 
 		 1139 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  36.34 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  36.81 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.67 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 380 aa  222  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  41.08 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  34.72 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  40.48 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  36.62 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  37.84 
 
 		 1135 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  39.57 
 
 		 1143 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.63 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.9 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  33.08 
 
 		 492 aa  219  5e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  40.59 
 
 		 408 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  35.44 
 
 		 401 aa  219  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  37.69 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1632  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.422734  hitchhiker  0.00000261738 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2095  cysteine desulfurase  44.27 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00656129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  37.99 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  37.84 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.43 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  40.43 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.66 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0442  putative aminotransferase  44 
 
 		 348 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0429876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  38.54 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  37.72 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.4 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  38.12 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  36.25 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.53 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  41.62 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  41.1 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  36.91 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  35.62 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  38.56 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  35.1 
 
 		 402 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  32.2 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  32.48 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  34.46 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  35.86 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  33.6 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2363  cysteine desulfurase  42.55 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  34.55 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  35.68 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  35.52 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>