More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0518 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 		 294 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0602  cytochrome c oxidase, subunit II  72.85 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  69.78 
 
 		 287 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  68.88 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  72 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  70.5 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  58.59 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  56.92 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  61.74 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  54.95 
 
 		 279 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  51.12 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  58.27 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  53.02 
 
 		 292 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  50.18 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  54.44 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  56.86 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  52.63 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  47.02 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  51.54 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  51.54 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  50.59 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  51.54 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  51.54 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  51.6 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  49.8 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  51.87 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  51.42 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  47.29 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  45.2 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  44.21 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  43.21 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  43.7 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  44.07 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  44.07 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 254 aa  205  9e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  47.9 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  45.8 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  40.23 
 
 		 401 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  41.49 
 
 		 385 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  40.84 
 
 		 385 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  37.33 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  43.1 
 
 		 400 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  41.15 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  41.77 
 
 		 418 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  41.77 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  40.45 
 
 		 422 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  41.63 
 
 		 247 aa  192  7e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  44.96 
 
 		 389 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  41.77 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40.82 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  40.56 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  44.22 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  42.44 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  41.42 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  38.08 
 
 		 532 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  38.08 
 
 		 532 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  38.08 
 
 		 532 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  38.08 
 
 		 531 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 		 532 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  37.8 
 
 		 521 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  38.8 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  37.27 
 
 		 402 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  38 
 
 		 513 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  37.6 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  43.04 
 
 		 392 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  37.85 
 
 		 518 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  37.85 
 
 		 518 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  37.85 
 
 		 518 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  37.85 
 
 		 518 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  39.46 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  38.06 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  36.33 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  37.6 
 
 		 513 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  36.75 
 
 		 538 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  39.92 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  36.72 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  37.72 
 
 		 535 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  39 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  38.99 
 
 		 525 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  37.16 
 
 		 524 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  37.72 
 
 		 535 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  37.16 
 
 		 513 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  38.02 
 
 		 524 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  37.73 
 
 		 544 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  36.4 
 
 		 512 aa  175  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  38.59 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  39.5 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  35.43 
 
 		 557 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  39.09 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  37.13 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  37.04 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 520 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  40.36 
 
 		 388 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  37.45 
 
 		 528 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  36.63 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>