156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0230 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 463 aa  940    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  55.41 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  55.19 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  54.36 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  53.76 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  54.03 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  51.75 
 
 		 453 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  39.83 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  38.31 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  35.59 
 
 		 493 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  36.25 
 
 		 515 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  31.16 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  29.33 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  29.97 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  29.41 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  30.65 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  30.92 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  26.91 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  25.9 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  27.65 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.18 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.13 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  24.18 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  24.18 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  23.02 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.18 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  26.47 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  23.02 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.18 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  26.02 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  25.44 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  24.46 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.29 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  26.02 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  27.8 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  27.78 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  26 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  25.22 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  25.11 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  26.55 
 
 		 509 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  24.89 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  23.83 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  28.52 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  26.09 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  26.81 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  29.79 
 
 		 508 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.3 
 
 		 520 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.06 
 
 		 490 aa  53.9  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  28.92 
 
 		 509 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  26.58 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  23.79 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  27.52 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  25.54 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  24.92 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  25.83 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  22.59 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  27.8 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  24.14 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  28.32 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  25.26 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  33.66 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  33.66 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  26.22 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  32.67 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  28.08 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.8 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  29.55 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  25.18 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  27.97 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.02 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  25.54 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  21.96 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  25.71 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.7 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  28.52 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  24.64 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  24.64 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  24.64 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.11 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  24.61 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  26.92 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0884  carbohydrate kinase FGGY  24.84 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.68 
 
 		 530 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  25.91 
 
 		 496 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  22.18 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.73 
 
 		 497 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  26.8 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  26.12 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>