More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1698 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  100 
 
 
406 aa  817    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  65.26 
 
 
399 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  64.21 
 
 
399 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  62.18 
 
 
403 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  55.76 
 
 
389 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  53.91 
 
 
389 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  52.58 
 
 
390 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  53.98 
 
 
387 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  55.99 
 
 
389 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  53.98 
 
 
387 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  53.98 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  53.28 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  53.47 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  53.47 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  53.98 
 
 
387 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  52.97 
 
 
392 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  53.49 
 
 
390 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  53.98 
 
 
387 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  53.02 
 
 
387 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  52.14 
 
 
388 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  56.77 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  52.69 
 
 
393 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  56.72 
 
 
373 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  56.81 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  52.82 
 
 
402 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  52.41 
 
 
395 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  52.7 
 
 
425 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  55.67 
 
 
407 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  54.57 
 
 
399 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  54.57 
 
 
396 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  54.57 
 
 
399 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  51.88 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  52.67 
 
 
396 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  53.12 
 
 
406 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  54.42 
 
 
407 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  51.34 
 
 
379 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  54.03 
 
 
396 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  53.66 
 
 
391 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 
398 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  54.3 
 
 
396 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  52.21 
 
 
396 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  53.66 
 
 
391 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  50.39 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  47.78 
 
 
412 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  51.47 
 
 
396 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.96 
 
 
397 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.65 
 
 
396 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  51.69 
 
 
396 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.35 
 
 
404 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  52.06 
 
 
396 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.87 
 
 
394 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50.79 
 
 
388 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  51.45 
 
 
393 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  52.23 
 
 
388 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  52.3 
 
 
405 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  52.23 
 
 
388 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  51.28 
 
 
398 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50.13 
 
 
396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.15 
 
 
401 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.09 
 
 
394 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  51.22 
 
 
389 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  50.92 
 
 
397 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.41 
 
 
401 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  51.34 
 
 
399 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.06 
 
 
396 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  51.76 
 
 
391 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.31 
 
 
397 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.43 
 
 
396 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.41 
 
 
402 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  45.55 
 
 
397 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  48.45 
 
 
395 aa  359  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  51.66 
 
 
394 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.19 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  52.23 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.84 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  49.2 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.8 
 
 
397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  44.81 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  44.67 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  51.92 
 
 
409 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 
387 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  43.24 
 
 
423 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  50.13 
 
 
390 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 
404 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  49.74 
 
 
390 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
389 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  43.4 
 
 
398 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
390 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  53.07 
 
 
395 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  43.37 
 
 
397 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>