192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5277 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5277  Peptidase M23  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  33.33 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.02 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  26.75 
 
 		 447 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  26.75 
 
 		 447 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  28.4 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32.39 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  27.6 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  29.79 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.84 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  34.75 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  32.26 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.97 
 
 		 454 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.17 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  32.26 
 
 		 421 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  32.26 
 
 		 421 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  30.66 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  26.11 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  35.66 
 
 		 457 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  32.31 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.53 
 
 		 524 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  33.08 
 
 		 433 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  27.22 
 
 		 425 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  27.22 
 
 		 425 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.21 
 
 		 323 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  31.62 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  28.24 
 
 		 392 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  34.4 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  33.33 
 
 		 414 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  31.67 
 
 		 372 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  30.28 
 
 		 319 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.77 
 
 		 445 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.21 
 
 		 554 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  29.03 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.59 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  31.69 
 
 		 387 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  34.29 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  35.43 
 
 		 630 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30.88 
 
 		 325 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  32.19 
 
 		 455 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  31.58 
 
 		 417 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  31.58 
 
 		 423 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  31.58 
 
 		 423 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  31.78 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  33.91 
 
 		 388 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  31.58 
 
 		 417 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.06 
 
 		 314 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  31.58 
 
 		 423 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  29.85 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  31.58 
 
 		 423 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  31.58 
 
 		 423 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  31.78 
 
 		 735 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  33.33 
 
 		 445 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2144  peptidase M23B  36.27 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0438532  normal  0.0198531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 754 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  31.58 
 
 		 424 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  31.03 
 
 		 328 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  33.06 
 
 		 309 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.94 
 
 		 453 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  33.83 
 
 		 460 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0391  Peptidase M23  35.96 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  29.69 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  26.09 
 
 		 414 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  27.39 
 
 		 491 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.9 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  29.31 
 
 		 367 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  28.48 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2287  peptidase M23B  34.88 
 
 		 331 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  35.59 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  28.95 
 
 		 384 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  29.61 
 
 		 471 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  33.33 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  28.48 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  34.45 
 
 		 455 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.05 
 
 		 301 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  32.26 
 
 		 324 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3030  peptidase M23B  34.95 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32.28 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  31.86 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  27.34 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  31.62 
 
 		 605 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  28.46 
 
 		 468 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2489  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 353 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  25.19 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  33.62 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  27.81 
 
 		 486 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  29.59 
 
 		 824 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  28.95 
 
 		 471 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  32.87 
 
 		 412 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  30.82 
 
 		 443 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  26.47 
 
 		 1048 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  31.58 
 
 		 414 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1204  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0665885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>