More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4034 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
335 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.71 
 
 
340 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.395332  normal  0.413116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.61 
 
 
334 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.64 
 
 
333 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3897  oxidoreductase NAD(P)-binding subunit  81.44 
 
 
294 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.66 
 
 
292 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.67 
 
 
333 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.58 
 
 
335 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.13 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.58 
 
 
335 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.58 
 
 
335 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  64.02 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.02 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.41 
 
 
337 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.21 
 
 
303 aa  342  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.39 
 
 
272 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.76 
 
 
297 aa  339  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  59.17 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.86 
 
 
299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3340  oxidoreductase  59.23 
 
 
294 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  59.23 
 
 
294 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  59.23 
 
 
294 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  59.23 
 
 
294 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  59.23 
 
 
294 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.27 
 
 
299 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0067  Short-chain alcohol dehydrogenase  56.36 
 
 
296 aa  332  7.000000000000001e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
297 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
294 aa  328  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  57.14 
 
 
294 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  57.49 
 
 
294 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  57.14 
 
 
294 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  57.14 
 
 
294 aa  328  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  57.14 
 
 
294 aa  328  9e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  56.79 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
293 aa  326  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0691  oxidoreductase  56.79 
 
 
294 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
293 aa  326  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.25 
 
 
293 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  55.9 
 
 
306 aa  322  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  56.4 
 
 
297 aa  322  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.84 
 
 
308 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
290 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0858  Short-chain alcohol dehydrogenase  54.7 
 
 
289 aa  315  6e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  55.48 
 
 
309 aa  315  9e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.04 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.43 
 
 
285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.06 
 
 
304 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 
290 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
298 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.9 
 
 
292 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
298 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
286 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  54.2 
 
 
293 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
285 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.52 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.45 
 
 
286 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.71 
 
 
297 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.1 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.9 
 
 
285 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.26 
 
 
286 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
285 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.82 
 
 
307 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
286 aa  299  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.19 
 
 
285 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.94 
 
 
286 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.96 
 
 
288 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  53.76 
 
 
285 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.06 
 
 
286 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  56.51 
 
 
285 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.93 
 
 
286 aa  291  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 
311 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.48 
 
 
286 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
286 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.68 
 
 
285 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  53.87 
 
 
288 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.9 
 
 
285 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 
285 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
306 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  53.57 
 
 
286 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.43 
 
 
285 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
288 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.06 
 
 
287 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.9 
 
 
296 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
292 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 
293 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
284 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
301 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
288 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
285 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 
287 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
295 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.77 
 
 
285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>