More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2494 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 297 aa  604  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.8 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0244  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01560  alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.04 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.29 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.15 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  26.09 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.62 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.62 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  23.63 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  25.96 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  39.32 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.87 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  31.01 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 		 371 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  24.92 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.32 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  24.8 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.35 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>