38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0965 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  38.38 
 
 		 924 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  100 
 
 		 902 aa  1868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  59.38 
 
 		 898 aa  1116    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  39.89 
 
 		 1077 aa  612  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  26.08 
 
 		 1142 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  37.82 
 
 		 1139 aa  89.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.33 
 
 		 1201 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.75 
 
 		 968 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  29.86 
 
 		 1143 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.84 
 
 		 1040 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  30.77 
 
 		 1110 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.71 
 
 		 1084 aa  75.5  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.5 
 
 		 1023 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.14 
 
 		 1390 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.45 
 
 		 1286 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  30.77 
 
 		 1141 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.17 
 
 		 864 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  30.47 
 
 		 1137 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.41 
 
 		 868 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  23.49 
 
 		 1439 aa  65.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  29.23 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  28.46 
 
 		 880 aa  64.7  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.12 
 
 		 1503 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  21.66 
 
 		 1058 aa  62.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.74 
 
 		 1027 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.69 
 
 		 1193 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.6 
 
 		 1149 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  22.55 
 
 		 394 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.82 
 
 		 1162 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.47 
 
 		 1181 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  26.32 
 
 		 460 aa  52  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  26.09 
 
 		 466 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.24 
 
 		 403 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.24 
 
 		 403 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 		 1505 aa  45.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 98 aa  45.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.27 
 
 		 168 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.96 
 
 		 1274 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>