More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0136 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
220 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.01 
 
 
225 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  34.88 
 
 
221 aa  161  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.8 
 
 
218 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 
219 aa  158  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  38.05 
 
 
456 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  37.07 
 
 
456 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  37.07 
 
 
456 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.41 
 
 
218 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.6 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  36.92 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
232 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.9 
 
 
229 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.47 
 
 
233 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.67 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.38 
 
 
232 aa  121  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.2 
 
 
232 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.2 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.87 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.23 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
221 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  29.03 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
225 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.27 
 
 
213 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
227 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.25 
 
 
217 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  34.8 
 
 
221 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
220 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  32.27 
 
 
237 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.23 
 
 
231 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  36.9 
 
 
227 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  36.9 
 
 
227 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
241 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  27.49 
 
 
216 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  30.27 
 
 
219 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 
226 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 
223 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  29.61 
 
 
216 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
222 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  31.28 
 
 
218 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  29.61 
 
 
216 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  29.61 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  34.31 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 
215 aa  99  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  34.92 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  35.83 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  29.13 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  29.13 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  29.13 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  29.13 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  29.61 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  32.66 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.71 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.57 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.37 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  34.63 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  31.07 
 
 
219 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.23 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.7 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.17 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  32.61 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  29.13 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  29.13 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  29.13 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
222 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.24 
 
 
219 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.7 
 
 
202 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.7 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  25 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  34.72 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.84 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  29.67 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.55 
 
 
223 aa  89  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.22 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  29.61 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  29.56 
 
 
221 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
207 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>