More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
574 aa  1157    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  64.44 
 
 
571 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  64.46 
 
 
569 aa  687    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  60.18 
 
 
553 aa  631  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.29 
 
 
562 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.28 
 
 
568 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.7 
 
 
562 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.65 
 
 
583 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  44.48 
 
 
584 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 
561 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 
559 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 
565 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 
582 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 
563 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 
563 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 
563 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.3 
 
 
582 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 
561 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 
561 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 
563 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 
561 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
561 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 
561 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
566 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
569 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 
591 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
551 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 
590 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
549 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
577 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 
564 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  39.67 
 
 
551 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 
584 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 
559 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
564 aa  360  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  37.57 
 
 
560 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
561 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
573 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
559 aa  352  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
578 aa  350  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
575 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
572 aa  349  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
558 aa  349  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
559 aa  349  9e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
566 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
577 aa  342  9e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 
585 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0606256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
563 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
554 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 
585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.22 
 
 
557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1573  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.750238  hitchhiker  0.00328561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 
562 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 
565 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
557 aa  337  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
584 aa  336  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 
565 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 
569 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.17 
 
 
569 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 
557 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
594 aa  335  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
583 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
557 aa  334  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
558 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
561 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
578 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0770506  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
561 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3653  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
578 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
561 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
561 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.93 
 
 
565 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
559 aa  333  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
561 aa  333  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 
565 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
557 aa  332  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 
569 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
561 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
557 aa  330  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
569 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.34 
 
 
563 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  35.66 
 
 
557 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
566 aa  330  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
566 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 
561 aa  329  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.46 
 
 
565 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  35.28 
 
 
561 aa  329  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 
583 aa  329  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  35.28 
 
 
561 aa  329  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 
561 aa  329  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 
561 aa  329  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 
561 aa  329  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 
583 aa  329  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 
577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  35.74 
 
 
569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>