More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  100 
 
 		 333 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  88.34 
 
 		 337 aa  597  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  86.71 
 
 		 332 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  81.38 
 
 		 333 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  81.62 
 
 		 339 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  78.92 
 
 		 334 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  76.88 
 
 		 333 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  76.07 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  75.45 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  76.13 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  71.99 
 
 		 335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  71.99 
 
 		 335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  80.39 
 
 		 317 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  71.43 
 
 		 339 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  71.13 
 
 		 347 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  79.74 
 
 		 312 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  78.03 
 
 		 311 aa  504  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  81.13 
 
 		 306 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  80.2 
 
 		 332 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  77.42 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  77.42 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  78.03 
 
 		 329 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  77.42 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  77.35 
 
 		 317 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  77.56 
 
 		 331 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  77.96 
 
 		 305 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  77.38 
 
 		 324 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  75.32 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  75.24 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  79.26 
 
 		 323 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  68.47 
 
 		 340 aa  487  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  76.87 
 
 		 311 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  75.82 
 
 		 308 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  68.17 
 
 		 335 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  71.79 
 
 		 328 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  72.52 
 
 		 320 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  67.46 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  71.61 
 
 		 333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  71.8 
 
 		 308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  71.05 
 
 		 323 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52.01 
 
 		 303 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52.01 
 
 		 303 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.85 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  49.27 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.28 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  50.19 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  50 
 
 		 535 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.76 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.26 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  44.88 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  44.29 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  44.29 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  44.44 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  47.56 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  45.42 
 
 		 330 aa  265  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  46.52 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  45.62 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.13 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  44.93 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  45.77 
 
 		 321 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  44.6 
 
 		 314 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  44.93 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  44.03 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  44.53 
 
 		 292 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  43.8 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  45.96 
 
 		 320 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  43.86 
 
 		 317 aa  258  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  42.05 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  42.05 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  46.32 
 
 		 339 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>