More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3158 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  99.54 
 
 		 434 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  891    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  99.31 
 
 		 434 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  64.75 
 
 		 433 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  69.12 
 
 		 433 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  65.44 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  64.3 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  64.07 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  63.16 
 
 		 436 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  63.16 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  63.39 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  60.18 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  59.95 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  57.99 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  55.73 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  40.45 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  40.14 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  36.47 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 432 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  22.42 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.15 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  21.25 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.01 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.45 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  25.08 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  21.57 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.32 
 
 		 667 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.95 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.32 
 
 		 667 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  23.21 
 
 		 804 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  25.4 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.28 
 
 		 813 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  25 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  25 
 
 		 682 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  21.74 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.95 
 
 		 789 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.13 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.39 
 
 		 805 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 		 789 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  23.79 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  25.53 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  19.38 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  23.83 
 
 		 807 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.77 
 
 		 844 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  22.15 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.56 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  21.57 
 
 		 806 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  23.45 
 
 		 663 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  22.9 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  22.32 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  22.35 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 811 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  21.53 
 
 		 652 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  22.54 
 
 		 663 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  23.63 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.01 
 
 		 642 aa  76.6  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  24.51 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.32 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  22.53 
 
 		 696 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  21.02 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  20.04 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.19 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  21.34 
 
 		 818 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  21.97 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  23.86 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  23.6 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  20.18 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  20.63 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  21.01 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  22.42 
 
 		 653 aa  73.6  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.16 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.12 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 797 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  21.69 
 
 		 641 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  21.65 
 
 		 654 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  20.63 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  23.08 
 
 		 658 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.54 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  21.9 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  21.38 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  21.88 
 
 		 811 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  20.66 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  23.72 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.47 
 
 		 648 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  20.57 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  21.12 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>