260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2353 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  94.24 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  86.86 
 
 		 289 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  74.73 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  68.07 
 
 		 318 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  66.78 
 
 		 318 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  66.9 
 
 		 309 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  66.2 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  43.13 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  43.09 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.48 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  34.6 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  31.66 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  32.66 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  30.4 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  29.1 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  27.08 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.75 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.43 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.27 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.75 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  24.1 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  29.35 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  34 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.14 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.98 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  22.48 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.5 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.46 
 
 		 392 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.96 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.95 
 
 		 562 aa  52.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  21.57 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  30 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  22.35 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.43 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  21.96 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  25.82 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  23 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  23.58 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.96 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  33.64 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  22.01 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1827  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  22.63 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  32.26 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  21.57 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.54 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  21.57 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  24.59 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.6 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.97 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  22.32 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>