69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0491 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0491  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3539  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  98.66 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0492  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  96.43 
 
 		 224 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3874  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  86.61 
 
 		 224 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0482  formate-dependent nitrite reductase, nrfG protein  75 
 
 		 224 aa  341  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3361  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  64.71 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3999  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  61.43 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0496  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0506  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.979581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0351  TPR repeat-containing protein  43.95 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.590847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4453  TPR repeat-containing protein  41.99 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0482  hypothetical protein  44.51 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.62875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0485  cytochrome c biogenesis factor-like protein  44.44 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.653619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4474  hypothetical protein  40.78 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  38.3 
 
 		 417 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 416 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.97 
 
 		 416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 415 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 415 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  34.62 
 
 		 415 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  36.96 
 
 		 403 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 417 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 417 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  31.69 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.15 
 
 		 417 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  31.15 
 
 		 417 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  31.15 
 
 		 417 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 415 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.55 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  26.32 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 398 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.09 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  31.44 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4321  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4597  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3916  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4632  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03948  heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4538  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5581  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03908  hypothetical protein  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3951  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 397 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  25.93 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  31.11 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4626  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  31.11 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.70936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2729  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.6 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2426  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.6 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  31.11 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  31.11 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4676  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  31.11 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003112  cytochrome c-type heme lyase subunit nrfG nitrite reductase complex assembly  33.1 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02729  hypothetical protein  31.47 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  26.46 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  29.41 
 
 		 418 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1996  putative formate-dependent nitrite reductase complex NrfG subunit  28 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 466 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 523 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  23.2 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0926  hypothetical protein  23.2 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 443 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 389 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 635 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 635 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>