66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3999 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3999  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3361  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  74.21 
 
 
226 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0482  formate-dependent nitrite reductase, nrfG protein  64.57 
 
 
224 aa  291  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3874  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  63.68 
 
 
224 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3539  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  62.33 
 
 
224 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0492  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  62.78 
 
 
224 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0491  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  61.43 
 
 
224 aa  264  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0496  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 
240 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4453  TPR repeat-containing protein  43.04 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0506  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 
237 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.979581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0351  TPR repeat-containing protein  43.95 
 
 
230 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.590847  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0482  hypothetical protein  45.11 
 
 
245 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.62875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0485  cytochrome c biogenesis factor-like protein  36.44 
 
 
235 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.653619  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4474  hypothetical protein  41.95 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
416 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.84 
 
 
416 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 
415 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
417 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
415 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
415 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  31.94 
 
 
417 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  34.24 
 
 
403 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 
415 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  32.46 
 
 
415 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
417 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  29.17 
 
 
417 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.42 
 
 
417 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  28.42 
 
 
417 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  28.12 
 
 
417 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
415 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  24.74 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.31 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.29 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4676  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.29 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248769  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.29 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.29 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4626  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.56 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.70936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  28.36 
 
 
400 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.41 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
397 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3951  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.15 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4321  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.15 
 
 
198 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5581  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.15 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4597  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.15 
 
 
198 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03908  hypothetical protein  34.15 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03948  heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfG  34.15 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4632  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.15 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4538  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.75 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3916  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2426  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.2 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
403 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  29.56 
 
 
418 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2729  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  34.4 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003112  cytochrome c-type heme lyase subunit nrfG nitrite reductase complex assembly  32.8 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  28.68 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0926  hypothetical protein  23.81 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  24.6 
 
 
407 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02729  hypothetical protein  31.2 
 
 
207 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  26.23 
 
 
406 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
443 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
296 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1996  putative formate-dependent nitrite reductase complex NrfG subunit  25.4 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  30.1 
 
 
405 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 
466 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  24.41 
 
 
436 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>