68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0492 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0492  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  100 
 
 
224 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3539  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  97.77 
 
 
224 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0491  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  96.43 
 
 
224 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3874  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  87.05 
 
 
224 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0482  formate-dependent nitrite reductase, nrfG protein  76.34 
 
 
224 aa  343  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3361  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  66.06 
 
 
226 aa  284  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3999  formate-dependent nitrite reductase, NrfG protein  62.78 
 
 
228 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0496  TPR repeat-containing protein  44.16 
 
 
240 aa  197  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0506  TPR repeat-containing protein  41.92 
 
 
237 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.979581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4453  TPR repeat-containing protein  43.72 
 
 
234 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0351  TPR repeat-containing protein  44.84 
 
 
230 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.590847  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0482  hypothetical protein  45.98 
 
 
245 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.62875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0485  cytochrome c biogenesis factor-like protein  46.91 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.653619  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4474  hypothetical protein  42.7 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  38.83 
 
 
417 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
415 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
415 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
416 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.07 
 
 
416 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  36.96 
 
 
403 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
415 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  34.07 
 
 
415 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
415 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
417 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 
417 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  32.24 
 
 
417 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  31.69 
 
 
417 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.69 
 
 
417 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  31.69 
 
 
417 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
415 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  27.37 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.62 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.16 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  32.47 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4597  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5581  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4321  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4632  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3951  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03908  hypothetical protein  37.7 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3916  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03948  heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4538  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  37.7 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.33 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4626  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.33 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.70936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4676  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.33 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248769  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.33 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  33.33 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  26.46 
 
 
407 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2729  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.2 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
403 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
397 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003112  cytochrome c-type heme lyase subunit nrfG nitrite reductase complex assembly  34.48 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2426  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  35.2 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
296 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02729  hypothetical protein  32.17 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  26.98 
 
 
406 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  29.95 
 
 
418 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1996  putative formate-dependent nitrite reductase complex NrfG subunit  28.35 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 
466 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  26.87 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0926  hypothetical protein  26.95 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  31.13 
 
 
405 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
523 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
443 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
635 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
635 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>