More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4053 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 383 aa  788    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  62.66 
 
 		 381 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  61.52 
 
 		 379 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  59.37 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  56.68 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  55.05 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  51.95 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  50.92 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  44.44 
 
 		 385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  42.04 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  40.77 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  43.75 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  42.34 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  43.9 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  42.82 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  41.25 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  40.99 
 
 		 393 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  41.04 
 
 		 394 aa  282  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  38.9 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  41.19 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  42.04 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  38.72 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  42.29 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  38.7 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  40.21 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.79 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  39.12 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  38.08 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  40.05 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  35.86 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  39.23 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  40.74 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  39.07 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  39.49 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  39.16 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  38.5 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  39.63 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  39.33 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.41 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  39.69 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  38.95 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  39.21 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  39.69 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  39.69 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  37.21 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  42.18 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  41.78 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  39.43 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  41.94 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  42.18 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  39.43 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  39.43 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  39.16 
 
 		 414 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  39.37 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  38.78 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  37.34 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  39.15 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  39.16 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  40.93 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  39.16 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  39.59 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  39.06 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  35.92 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  36.51 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  37.9 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  36.41 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  35.66 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  35.66 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  36.78 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  39.38 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  37.03 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  41 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  36.95 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  34.86 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  35.58 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  39.34 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  35.97 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  37.11 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  36.95 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  39.5 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  38.9 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  39.33 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  36.53 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  39.23 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  39.23 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  37.89 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  38.67 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  38.95 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  38.4 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  38.95 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  39.06 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>