More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3420 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  60.8 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  59.84 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  52.65 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  54.03 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  53.25 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4055  hypothetical protein  54.36 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  37.14 
 
 		 2798 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  32.77 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  36.09 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  35.65 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  35.65 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  35.65 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  35.65 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  35.65 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  35.65 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  35.65 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  33.49 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.38 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  32.72 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  32.26 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30.8 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  32.56 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  32.56 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  32.11 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  26.54 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  30.29 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.95 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.3 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  29.47 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  27.51 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  38.32 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  40.38 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  27.52 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  38.61 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  32.23 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  34.21 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.31 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  31.82 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.5 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.97 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.97 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  31.48 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  30.32 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  36.45 
 
 		 121 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  23.53 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  27.07 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  25.64 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.39 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.27 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  32.41 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.02 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  30.52 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  28.39 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  27.65 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  26.64 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  28.02 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.27 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  25.12 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  29.82 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  25.94 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.6 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  25.94 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.39 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  37.86 
 
 		 117 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  34.95 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.46 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  25.57 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  27.67 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.13 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  25.9 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.56 
 
 		 123 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  27.54 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  26.83 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  30.59 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  32.14 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  34.51 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  28.52 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  27.14 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  25.78 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>