More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2141 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  564  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  65.05 
 
 		 289 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  40 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  40 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.68 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  34.27 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0116  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  32.32 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.92 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.58 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  34.06 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.88 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.58 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.97 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.77 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  33.23 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>