59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1269 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  39.61 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  35.44 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.44 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  35.44 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  35.44 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  35.44 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  34.81 
 
 
167 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  35.93 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  36.6 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  33.33 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  36.13 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  33.33 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  33.33 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  33.33 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  33.33 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  33.33 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  34.9 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  36.36 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  29.19 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  28.57 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  28.57 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  28.57 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  28.57 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  35.65 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  35.65 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  35.65 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  35.65 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  27.94 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  35.65 
 
 
172 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  28.89 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  30.19 
 
 
348 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.21 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.21 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.85 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.59 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.21 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.21 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.21 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  28.85 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.83 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.59 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.59 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.85 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.59 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.59 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.59 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  27.43 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.86 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  26.86 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  26.86 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  26.86 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  32.38 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  22.73 
 
 
186 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  25.35 
 
 
193 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  26.92 
 
 
354 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  25.35 
 
 
193 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  29.75 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>