46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1587 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  100 
 
 		 321 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  43.61 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  36.73 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  33.43 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  34.55 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  34.12 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  33.03 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  32.24 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  31.54 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  35.92 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  30.8 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  34.64 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  28.68 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  26.75 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  28.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  28.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  35.67 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  31.34 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  28.81 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  27 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  27.89 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  29.22 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  29.22 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  26.17 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  23.91 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.62 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  33.97 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  26.34 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  22.44 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  25.26 
 
 		 488 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  24.74 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  24.49 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  28.23 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.16 
 
 		 392 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  26.35 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  25.85 
 
 		 376 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  25.42 
 
 		 403 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  25.67 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  26.58 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>