More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3552 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  57.39 
 
 		 270 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  36.7 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 115 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 138 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 114 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 114 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 		 138 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 		 138 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 114 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 114 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 116 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 114 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 115 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 115 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 114 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  46.96 
 
 		 115 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  51.75 
 
 		 114 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 115 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  49.12 
 
 		 114 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  46.49 
 
 		 114 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 114 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 		 138 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 118 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 115 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  47.32 
 
 		 116 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  49.53 
 
 		 134 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  45.37 
 
 		 113 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 133 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 110 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  45.22 
 
 		 145 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 115 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  41.23 
 
 		 118 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  46.15 
 
 		 128 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  44.35 
 
 		 115 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  46.36 
 
 		 117 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  45.95 
 
 		 115 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 120 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 124 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 		 142 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.12 
 
 		 140 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.66 
 
 		 143 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.29 
 
 		 117 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  44.55 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.29 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  44.55 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.55 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.55 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.29 
 
 		 117 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 117 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.56 
 
 		 117 aa  92.4  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 150 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 		 139 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.51 
 
 		 113 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.63 
 
 		 106 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.51 
 
 		 113 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.51 
 
 		 113 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 110 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 113 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  39.01 
 
 		 156 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38 
 
 		 106 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.18 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.1 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  38.3 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.12 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  44.32 
 
 		 111 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 135 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 109 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  44.57 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.39 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  34.48 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  36.88 
 
 		 156 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 156 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 		 171 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  38.02 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  35.34 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  36.31 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>