More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1182 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  52.19 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  48.92 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 		 273 aa  275  8e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 		 273 aa  274  9e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  49.64 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  48.91 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  50.36 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  44.53 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  44.36 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.6 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.21 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  31.32 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  31.72 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  27.64 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  30.15 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  30.93 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.13 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  31.06 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  29.68 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  29.14 
 
 		 355 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  30.55 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  30.77 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  34.12 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  31.39 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  32.19 
 
 		 355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  27.21 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.76 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  30.53 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  30.12 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  30.26 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  33.33 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.41 
 
 		 336 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.37 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 		 339 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  28.93 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  30.39 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  31.88 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  35.82 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  29.97 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  29.02 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.07 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  28.77 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  27.68 
 
 		 336 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  29.33 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  35.24 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  28.06 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  29.2 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  28.21 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0692  thiamine-monophosphate kinase  31.12 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447236  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  28.87 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  29.54 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.6 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.18 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  32.95 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.39 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  28.83 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  28.99 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  27.64 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  28.78 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  27.95 
 
 		 319 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  29.88 
 
 		 315 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.63 
 
 		 363 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.38 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  27.8 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  28.41 
 
 		 322 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  29.09 
 
 		 343 aa  99  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 321 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  31.77 
 
 		 323 aa  98.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>